دکتر سید مجتبی امامی دارای مدرک کارشناسی و کارشناسی ارشد در رشته معارف اسلامی و مدیریت دولتی از دانشگاه امام صادق (ع) و دکتری در رشته مذکور گرایش تصمیمگیری و خطمشی گذاری عمومی از دانشگاه تهران، پردیس قم هستند.
حوزه های مطالعاتی و پژوهشی ایشان عبارت اند از: خط مشی گذاری عمومی، واکاوی الگوی اسلامی - ایرانی پیشرفت