اولویت اول

علوم قرآن و حدیث

1. معانی قرآن کریم با عنایت به مباحث میان رشته‌ای (زبان‌شناسی، معناشناسی و مردم‌شناسی)
2. فقه‌الحدیث با عنایت به مباحث میان رشته‌ای معناشناسی
3. روش‌شناسی تفسیر به ویژه در حوزه تفسیر معاصر
4. توسعه روش‌های نقد حدیث با عنایت خاص به نقد متن‌محور

فلسفه و کلام:

1. پژوهش‌های مساله‌محور (محورهای بازخوانی و استنباط) : معرفت‌شناسی، هستی‌شناسی و انسان‌شناسی و فلسفه‌های مضاف

فقه و مبانی حقوق:

1. پژوهش‌های فرامعرفتی مانند فلسفه/ فقه
2. پژوهش‌های میان رشته‌ای مابین فقه و سایر علوم: فقه و حقوق، فقه و اقتصاد، فقه و مدیریت و ....

اولویت دوم

علوم قرآن و حدیث:

1. تفسیر قرآن کریم با عنایت به نیازهای عصر حاضر و توسعه روش‌ها
2. تاریخ مصحف شریف و قرائات با تکیه بر حوزه ایران و تشیع

فقه و مبانی حقوق:

1. مسائل مبتلی‌به و موردنیاز جامعه مانند پیوند اعضاء، شبیه‌سازی، بیع متقابل، اوراق مالی و .....

فلسفه و کلام:

1. پژوهش‌های تطبیقی: مقایسه آراء فیلسوفان و متکلمان دو نظام فلسفی و کلامی مسلمانان با یکدیگر یا مقایسه آراء یکی از فیلسوفان و متکلمان مسلمان با آراء یکی از فیلسوفان مغرب زمین

اولویت سوم

فقه و مبانی حقوق:

1. نظام حقوقی اسلام و مقایسه آن با سایر نظام‌های حقوقی با نگاه سیستمی

اولویت چهارم

علوم قرآن و حدیث:

1. ترجمه قرآن کریم و کوشش برای دستیابی به مبانی علمی نقد و ارزیابی آن
2. کتابشناسی تاریخی و تحلیلی در حوزه قرآن‌شناسی و تفسیر
3. تاریخ تدوین و سبک‌های تدوین در حدیث

فقه و مبانی حقوق:

1. تاریخ فقه و اصول فقه
2. روش‌شناسی اجتهاد و مکاتب فقهی + بحث‌های تطبیقی در سطح توصیف و تحلیل

فلسفه و کلام:

1. بررسی نظریات مختلف در مورد یک مساله فلسفی در طول تاریخ یا یک دوره زمانی خاص
2. پژوهش‌های شخص‌محور (تبیین اندیشه‌های فلسفی یا کلامی یک فیلسوف) + پژوهش‌های شرح‌محور